水上バスはアイデアとしては良いと思いますが、現実問題として、信濃川と鳥屋野潟の水面の高さがかなり違うので、鳥屋野潟の水をポンプアップして、信濃川に排水している状態です。
よって新たに閘門を作り、水面の高さを調整しながら行来しなければならないため不可能ですね。