別に指定席だからってマナー違反にはならないと思います。しかし、立って応援したりしたら、後ろの方に迷惑かと思います。
自分は浦和戦の時だけは指定で、後はｻﾎﾟｼなんですが、やはり声出したくてウズウズしますが、回りは誰も出してないので、手拍子のみで応援してます。
けど、後半で「奇跡をおこせ」なんかが始まると、回り関係なく声出してしまいますね・・・（＾＾；）