できますよ
当日に総合チケットセンターでその旨伝えれば、差額を払ってランクアップしてもらえます
ただ、ヤンマースタジアムはカテゴリー3も5も自由席だし、5の方が見やすくて広いので
個人的にはあんまり席種変更の必用性は感じませんが…