決勝ラウンド１位、２位チームは以下のＪＦＬチームとの入れ替え戦等の結果により最大２チームの入会を決定する。
　ＪＦＬ１７位チームは自動降格、１６位チームは、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ１位チームと、１５位チームは、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ２位との入れ替え戦を行う。Ｊ３へ１チーム入会した場合、１７位チームは、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ１位チームと、１６位チームは、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ２位との入れ替え戦を行う。Ｊ３へ２チーム入会した場合、１７位チームは、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ２位チーム入れ替え戦を行い、全国地域サッカーチャンピオンズリーグ１位チームは自動昇格とする。