ホームアウェイの裸、どこの組織からから禁止されるかによるでしょうね。
仮にCスタのスタジアム規則で裸NGになってアウェイスタジアムで同様の規定がない場合、アウェイでどのような服装であろうと強制力をもってどうにかする権利はありません。
そして、ファジサポ団体の規定によって裸の応援NGにしようとなった場合、それはアウェイでも同様にNGにすべきでしょうね。

まあ個人的にはホームCスタで裸NGなのにアウェイでは堂々と裸になるっていうのはより悪質なマナー違反だと思いますね。
海外の観光地で落書きする日本人旅行者と同じで、相手側に悪い印象を与えるのは間違いないと思います。