整理します。

移籍金の内、過去育成年代に所属したチームへ総額で5%が分配される。
年代により割合が異なり、FC岐阜の場合は1年分の0.5%が受け取れる権利を有する。

つまり仮に報道の50億円ならば2,500万円と言う事になります。

移籍金の発生する移籍をする毎にその0.5％を受け取る権利が発生します。