星の付け方についてはクラブごとに捉え方が違うので、お達しが出ない限り、統制は難しいと思います。
カップ戦も立派な「星」ですけど、リーグ戦とは位置付けもレギュレーションも違う。
（どっちの方がすごい！とかいう話ではないよ）

星を付ける位置を変えたり、何らかの工夫があれば分かりやすいんだけどなー。
例えばリーグ戦ユニの場合、エンブレムの上にはリーグ制覇の星、エンブレムの下にはカップ制覇の星を配置するとか。

星の色を変えるとか、大きさを変えるとかも考えたけど、それは何か違う気がしたので。