甲子園（と地方大会）はそもそも長期休暇（春休みと夏休み）に頼り切った日程組まれてるから休暇短縮が予想される中ではどうしても破綻しちゃう

それでも公欠扱いでやっちまえば良いという意見もあるだろうが、高校野球は憲章の初っ端で『学校教育の一環』と言い切ってるので、（少なくも表向きは）学業優先の姿勢は崩せないでしょう

移動と宿泊の問題はプロスポーツでもあるだろうけど、そこらへんは大きく異なると思うよ