明治安田J2は2021シーズンも22クラブで開催。開幕は2月27日、閉幕は12月5日(日)となる。全42節、462試合はこれまでと変わらず、試合方式も変わらない。

なお、2020シーズン同様にリーグ戦の上位2クラブのみが自動昇格。新シーズンもプレーオフは実施されないことが決定した。さらに、2020シーズンの降格がなかったため、下位4クラブがJ3へ自動降格することとなる。