クラブが違約金一方的に上がることなんてできないよ。選手と新しく契約結ぶしかできないと思う。ただ、実際違約金満額払わなくても移籍が成立することも多々ある。
例えば今回の例だと、違約金が2億で、徳島が1億(仮に)でオファー。しかし、新潟は満額払わないと出す意思がなかったってことかと。