アッパーでもL旗振って大丈夫ですよ。高らかに振って下さい。
ただ、試合のインプレーの時は振るのはご遠慮願います。
基本的には試合前、ゴール決まった時、ハーフタイム、試合後ですね。

まあ、アッパーでも沢山の人が旗を振ると思いますし、その中で降り時を分かっている人も多いと思うので、基本的には周りに合わせて振っていれば良いと思います。