私は長崎市内から車で行くので駅の混雑具合はわかりかねますが……
シャトルバスについてはホームページにこのような記載があるので路線バスしかないのかもしれません。。

ただ、行きは30分程歩きますがvファーレンロードなるものがあり
色んなおもてなしを感じていただける道のりになっていますので、お天気次第ですが行きは歩いて帰りはバスorタクシーで諫早駅が良いかもですね(*^^*)