呉屋選手出場できますよ。
開催規則の第10条3項に
（３） 本大会に出場した選手は、チームを移籍、または、クラブ申請制度を利用することで
２チーム以上のために試合に出場することはできない。
＊出場とは、公式記録に１分以上記載された場合をいう 。

なので、ガンバで登録されていても出場していないのでOKです。
何より4回戦（ラウンド16）で後半最後に出場できているので、
問題ないと思います。