観光なら長崎市内の方がいいと思いますよ。
グラバー園、中華街、眼鏡橋。。以外に近いし。
お泊まりならなおさら市内。
夜は稲佐山の夜景なんかいいかもです。
食べ物もおいしいと思いますので楽しんで下さいね。