「V」には長崎と古くから歴史的つながりのあるポルトガル語・オランダ語の4つの言葉「勝利（VITÓRIA）」「多様性（VARIEDADE）」「航海（VAREN）」「平和（VREDE）」の想いを込めています。海に囲まれた長崎県全域をホームタウンとするサッカークラブが、長崎から世界へ「航海（VAREN）」に出るという意味で「V・ファーレン長崎」というチーム名になりました。