【2回戦】6/12(水)
ヴィッセル神戸(J1)　-　カターレ富山(富山)
徳島ヴォルティス(J2)　-　ベガルタ仙台(J2)
柏レイソル(J1)　-　グルージャ盛岡(岩手)
ＦＣ町田ゼルビア(J1)　-　筑波大(茨城)
セレッソ大阪(J1)　-　ジェイリースFC(大分)
ヴァンフォーレ甲府(J2)　-　Ｈｏｎｄａ ＦＣ(アマチュアシード)
アルビレックス新潟(J1)　-　ギラヴァンツ北九州(福岡)
Ｖ・ファーレン長崎(J2)　-　カマタマーレ讃岐(香川)
鹿島アントラーズ(J1)　-　奈良クラブ(奈良)
藤枝ＭＹＦＣ(J2)　-　栃木ＳＣ(J2)
サガン鳥栖(J1)　-　高知ユナイテッドSC(高知)
横浜ＦＣ(J2)　-　ヴァンラーレ八戸(青森)
名古屋グランパス(J1)　-　JAPANサッカーカレッジ(新潟)
ザスパ群馬(J2)　-　レノファ山口ＦＣ(J2)
京都サンガＦ.Ｃ.(J1)　-　大宮アルディージャ(埼玉)
清水エスパルス(J2)　-　三菱重工長崎SC(長崎)
横浜Ｆ･マリノス(J1)　-　FC岐阜(岐阜)
ロアッソ熊本(J2)　-　水戸ホーリーホック(J2)
ガンバ大阪(J1)　-　福島ユナイテッドFC(福島)
ジュビロ磐田(J1)　-　テゲバジャーロ宮崎(宮崎)
川崎フロンターレ(J1)　-　ソニー仙台FC(宮城)
大分トリニータ(J2)　-　鹿児島ユナイテッドＦＣ(J2)
ＦＣ東京(J1)　-　ヴィアティン三重(三重)
ジェフユナイテッド千葉(J2)　-　中京大学(愛知)
サンフレッチェ広島(J1)　-　FCバレイン下関(山口)
ブラウブリッツ秋田(J2)　-　いわきＦＣ(J2)
湘南ベルマーレ(J1)　-　甲南大学(兵庫)
東京ヴェルディ(J1)　-　AC長野パルセイロ(長野)
アビスパ福岡(J1)　-　福山シティFC(広島)
ファジアーノ岡山(J2)　-　愛媛ＦＣ(J2)
北海道コンサドーレ札幌(J1)　-　栃木シティ(栃木)
モンテディオ山形(J2)　-　SC相模原(神奈川)

【1回戦】5/25(土)・26(日)
ソニー仙台FC(宮城) 3-1 tonan前橋(群馬)
栃木シティ(栃木) 1-0 横河武蔵野FC(東京)
SC相模原(神奈川) 3-0 山梨学院大PEGASUS(山梨)
ツエーゲン金沢(石川) 1-1(PK3-4) 甲南大(兵庫)
FC岐阜(岐阜) 1-0 アスルクラロ沼津(静岡)
奈良クラブ(奈良) 3-2 京都産業大(京都)
東海大熊本(熊本) 0-4 三菱重工長崎SC(長崎)
テゲバジャーロ宮崎(宮崎) 4-0 川副クラブ(佐賀)
ヴァンラーレ八戸(青森) 2-0 ブリオベッカ浦安(千葉)
いわてグルージャ盛岡(岩手) 3-1 北海道十勝スカイアース(北海道)
福島ユナイテッドFC(福島) 9-0 大山サッカークラブ(山形)
筑波大(茨城) 1-0 明治大(アマチュアシード)
AC長野パルセイロ(長野) 7-0 猿田興業(秋田)
カターレ富山(富山) 3-0 関西大(大阪)
福井ユナイテッドFC(福井) 0-3 大宮アルディージャ(埼玉)
ヴィアティン三重(三重) 1-0 FC今治(愛媛)
びわこ成蹊スポーツ大(滋賀) 0-1 中京大(愛知)
アルテリーヴォ和歌山(和歌山) 1-2 JAPANサッカーカレッジ(新潟)
ガイナーレ鳥取(鳥取) 1-1(PK3-4) バレイン下関(山口)
三菱水島FC(岡山) 3-4 カマタマーレ讃岐(香川)
福山シティFC(広島) 3-0 沖縄SV(沖縄)
FC徳島(徳島) 0-1 ジェイリースFC(大分)
高知ユナイテッドSC(高知) 1-0 ベルガロッソいわみ(島根)
鹿屋体育大(鹿児島) 0-3 ギラヴァンツ北九州(福岡)