天皇杯自体は優勝を全力で目指すビッグタイトルですよ。ACLの出場権もかかってますし。
ただ、その2チームは優勝とかPOが掛かってますし、10月30日から中3日がずっと続くのでら、やむなくリーグ優先にしたって感じじゃないでしょうか？
横浜FCさんは、PO可能性「0ではない」ってレベルなので、本音では天皇杯優先したかったかもしれません。勝ってたら1000万貰えたので。