エンブレム、勝手な推測。

青はJリーグ発足時にユニフォームの色、エスパルスは青を希望したけど、マリノスやガンバなどの古参チームもブルー系を希望した為、新参者のエスパルスは遠慮してオレンジになった経緯が確かあった。
清水東や清水商は今も青が基調で清水は青のイメージが強かったからね。

だからエンブレムに青を入れてあるんじゃないのかな？