>> プレーを再開した後、主審がその決定が正しくないと気づいても、その他の審判員の助言を受けたとしても再開の決定を変えることはできない。
>つまり今治の審判はルールを無視した？

この場合のプレーの再開とは両チームがPKのセッティングをして主審が笛を吹いたときでしょう。
個人的には一度PKの判断をしたのに何故覆したのか気になりますが、ルール上問題はありませんし以前にも同じケースはありました。