マリノスの正式名称は横浜Fマリノス。略称だと横浜FMです。横浜FCはそのまま横浜FC。新聞などは略せるだけ略すので、マリノスと横浜FCを分けるためにM＝マリノス、C＝横浜FCにしています。
マリノスは発足時は横浜マリノスだったので横浜Mでも違和感ないですが、横浜Cだとやっぱり疑問を抱きますよね。
ちなみに川崎は川崎Fと表記されます。多分ですが、ヴェルディが昔川崎だったので、V川崎と川崎Fとを分けるために今も使ってるんだと思います