個人的には新幹線を軸にしたホーム・アウェイサポ両方アクセスしやすい熊本駅周辺が理想ですがそれが無理なら上熊本、もしくは西熊本駅あたりはどうでしょうか？
最悪菊陽（駅周辺なら）なら今よりはアウェイサポも行きやすくなるかもしれませんが